¿Cómo comprar una finca edificable y media rústica anexa?

Voy a comprar una finca edificable, al lado hay otra exactamente igual que también se vende, cuadradas. Al pie de ambas hay otra alargada rústica. Son todas del mismo propietario, una constructora. La constructora nos vende una edificable a cada uno, y media rústica a cada uno, de tal forma que al final nuestra propiedad se convierte en un rectángulo, parte edificable y parte no. ¿Cömo debe aparecer en las escrituras para no tener nunca problemas entre nosotros? He de tener una escritura por la finca edificable y otra diferente por la media finca rústica o puedo escriturar las dos como una (están pegadas)?

Por ahora he ido al ayuntamiento, para ellos constan separadas las dos fincas edificables. Pero la finca rústica aparece como una sola. ¿Es cierto que puedo hacerlo todo con el notario sin tener que pedir permisos al ayuntamiento o realizar cambios en él antes de la compra?

Pablo